Egyptin ensimmäinen presidentti oli Mohamed Naguib, yksi vapaiden upseerien liikkeen johtajista, joka johti Egyptin vallankumousta vuonna 1952 ja joka aloitti tehtävänsä 18. kesäkuuta 1953. päivä, jona Egypti julistettiin tasavallaksi. Siitä lähtien virkaa ovat olleet viisi muuta henkilöä: Gamal Abdel Nasser, Anwar Sadat, Hosni Mubarak, Mohamed Morsi ja Abdel Fattah el-Sisi. Lisäksi Sufi Abu Taleb toimi presidenttinä Sadatin murhan ja hänen seuraajansa valitsemisen välillä, ja Adly Mansour toimi presidenttinä sen jälkeen, kun Morsin kukistettiin vuoden 2013 vallankaappauksessa.

Hosni Mubarakin jälkeen ”eroaminen 11. helmikuuta 2011 Egyptin vallankumouksessa 2011, toimisto oli tyhjä, ja valtion päämiehen ja hallituksen päämiehen tehtävät hoiti asevoimien korkeimman neuvoston puheenjohtaja, feldamarsalkka Mohamed Hussein Tantawi.

Mohamed Morsi aloitti tehtävässään 30. kesäkuuta 2012 sen jälkeen, kun hänet oli valittu 23. – 24. toukokuuta ja 16. – 17. kesäkuuta 2012 pidetyissä presidentinvaaleissa. Egyptin asevoimat erottivat hänet vallankaappauksessa. 3. heinäkuuta 2013 hänen eroamistaan vaativien massiivisten mielenosoitusten jälkeen. Hänen seuraajansa toimi Egyptin korkeimman perustuslakituomioistuimen päällikkö Adly Mansour. .

Nykyinen presidentti el-Sisi aloitti tehtävänsä 8. kesäkuuta 2014 sen jälkeen, kun hänet oli valittu 26. – 28. toukokuuta 2014 pidetyissä presidentinvaaleissa. Hänet valittiin uudelleen 26. – 28. maaliskuuta 2018 pidetyissä presidentinvaaleissa.