Skibsværft startede først i 1992 som Kennebunkport Brewing Co. med grundlæggerne Fred Forsley og Alan Pugsley på Federal Jacks Restaurant og Brew Pub i Kennebunk, som er en af Maines originale bryg pubber og arbejdende bryggerier. Inden for to år overgik efterspørgslen efter øl fra Kennebunkport Brewing Co. den lille operation, og i april 1994 udvidede forretningsmanden Fred Forsley og brygger Alan Pugsley og åbnede Shipyard Brewing Company i hjertet af havnefronten i Portland, Maine på stedet for det tidligere Crosby Laughlin-støberi.
I 2008 bryggede Shipyard Brewing Company 81.641 tønder ale og afsendte 2.900 tønder sodavand. Dens produkter er tilgængelige i 40 stater.
Shipyard driver flere restauranter og kontraktbryggerier og er aktiv i mange samfundsprojekter rundt om i New England. Shipyard er partnere med Sea Dog Brewing Company og Casco Bay Brewing Company. Shipyard producerer også øl på kontrakt for Gritty McDuff’s Br ewing Company, brygger en amerikansk version af Old Thumper under licens fra Ringwood Brewery og distribuerer Capt “n Elis sodavand af sodavand.
Skibsværft, der tidligere blev brygget på Shipyard Emporium i Winter Park, Florida .