CIS’s funktioner er at koordinere medlemmernes politik med hensyn til deres økonomi, udenrigsforhold, forsvar, immigrationspolitik, miljøbeskyttelse og retshåndhævelse. Dets øverste regeringsorgan er et råd sammensat af medlemsrepublikernes statsoverhoveder (dvs. præsidenter) og af regeringen (premierministre), der bistås af komitéer fra republikkens kabinetsministre på nøgleområder som økonomi og forsvar. CIS’s medlemmer lovede at holde både deres væbnede styrker og de tidligere sovjetiske atomvåben stationeret på deres territorier under en samlet samlet kommando. I praksis viste det sig imidlertid vanskeligt, ligesom medlemmernes bestræbelser på at koordinere indførelsen af markedstypemekanismer og privat ejerskab i deres respektive økonomier.
I august 2008, efter en eskalering af fjendtlighederne mellem Rusland og Georgien over den separatistiske region Sydossetien, meddelte Georgien sin hensigt om at trække sig ud af SNG. Tilbagetrækningen blev afsluttet i august 2009. En lignende fuldmagtskrig brød ud i det østlige Ukraine i 2014 efter Ruslands ulovlige annektering af den ukrainske autonome republik Krim. I 2018 var mindst 10.000 mennesker dræbt i sammenstød mellem ukrainske væbnede styrker og russisk-støttede paramilitære enheder i Donets-bassinet. I maj samme år ukrainske præs. Petro Poroshenko trak officielt Ukraines medlemskab ud af SNG.